畜禽養殖污水屬于富含大量病原體的高濃度有機污水，直接排放進入水體或存放地點不合適，受雨水沖洗進入水體，將可能造成地表水或地下水水質的嚴重惡化。

由于養殖污水處理屬于高有機物濃度、高N、P含量和高有害微生物數量的“三高”污水。因此厭氧技術成為畜禽養殖場糞污處理中不可缺少的關鍵技術。對于養殖場這種高濃度的有機污水，采用厭氧消化工藝可在較低的運行成本下有效地去除大量的可溶性有機物，COD去除率達85%～90%，而且能殺死傳染病菌，有利于養殖場的防疫。

國內外對規模化畜禽場糞水的處理方法主要有綜合利用和處理達標排放兩大類。綜合利用是生物質能多層次利用、建設生態農業和保證農業可持續發展的好途徑。但是，目前由于我國畜禽場飼養管理方式落后，加上綜合利用前厭氧處理的不到位，常使畜禽糞水在綜合利用的過程中產生許多問題，如污水產生量大、成分復雜、處理后污染物濃度仍很高、所用稀釋水量多和受季節灌溉影響等。對于處理達標排放的來講，雖然國內外所用的工藝流程大致相同，即固液分離-厭氧消化-好氧處理。但是，對于我國處于微利經營的養殖行業來講，建設該類糞污處理設施所需的投資太大、運行費用過高。